Kenji Fujikido là nhân viên văn phòng mất vợ con trong cuộc tranh giành địa bàn đẫm máu của ninja. Trong gang tấc giữa lằn ranh sinh tử, anh bị linh hồn ninja bí ẩn Naraku nhập vào — thoát chết và trở thành "Ninja Slayer", tử thần diệt ninja ác, dấn thân vào cuộc chiến báo thù cá nhân. Giữa thế giới ngầm loạn lạc Neo-Saitama, anh đối đầu sinh tử với các ninja của tổ chức Soukai trong những trận chiến mãn nhãn đậm chất cyberpunk.